中国地质博物馆烟台馆暨烟台自然博物馆共设15个厅馆,包括主题序厅、地球厅、化石厅、矿产厅、黄金一厅、黄金二厅、黄金地下采场、生物厅、根雕艺术馆、观赏石馆、王懿荣馆、内画馆、美术馆、四大名著根雕馆、中华第一砚馆。馆藏各类藏品近万件。